SAMPLE DELIVERY GUIDE
送样指南
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原核转录组篇1、物种没有参考基因组,可以做原核转录组分析吗? 原核转录组要求有参考基因组,因为原核生物的mRNA一般为多顺反子,直接拼接效果较差。 2、原核转录组和真核转录组有什么区别? (1)对于mRNA,原核转录组mRNA没有polyA尾结构,通常使用去核糖体RNA方式进行捕获;而真核mRNA-seq通常使用polyd(T)捕获的方式建库。 (2)真核转录组除了mRNA-seq,还有ncRNA-seq产品,比如miRNA、lncRNA、circRNA和全转录组,原核转录组是没有这些产品的。 (3)对于分析内容,真核转录组主要为差异基因的表达量和功能富集分析;原核转录组由于基因组的结构特征,会存在很多功能相关的基因前后相连成串,由一个共同的控制区进行转录调控的操纵子结构,所以会有操纵子分析;另外由于无法对原核转录组进行单独的sRNA测序,所以在分析时会进行sRNA预测;这是原核转录组与真和转录组分析差异的主要两个部分。 3、原核转录组要怎么送样? 比较常见的是细菌,一般要求1×10^6/样(2管,1管备份)。 |